تعد هذه الشعبة من الشعب المستحدثة في قسم الشؤون المالية والتي كانت احدى وحدات شعبة الموازنة الاعتيادية وبسبب التطور الحاصل في مجال الشمول المالية في العراق وبداية العمل في توطين الرواتب تم استحداث هذه الشعبة وتتكون من اربعة وحدات ترتبط بمسؤول الشعبة والتي يقع على عاتق هذه الشعبة كافة النشاطات التي تخص الرواتب وعمليات التسجيل والصرف ومتابعة تمويل الرواتب ومتابعتها شهريا مع وزارتي التعليم العالي والبحث العلمي ووزارة المالية ومتابعة المناقلات بين اعتمادات تخصيصات الموازنة التي تخص المنقولين الى الجامعة بالإضافة الى تسهيل وتقديم المشورة بخطوات اصدار البطاقة الالكترونية من المصارف المتعاقد معها رسمياً . واجراء صرف الرواتب بعد التأكد من تعزيز حساب الجامعة بشكل شهري بعد التواصل المستمرة مع البنك المركزي العراقي الكترونياً لغرض مطابقة قيود الصرف لجميع رواتب منتسبي الجامعة وتأكد من صحة البيانات المصرفية لكل منتسب بعدها يتسنى للشعبة تحرير مستندات الاشعار المصرفي والتواصل مع ادارة المصارف المتعاقد معها في توطين رواتب منتسبي الجامعة لضمان صرف كافة المستحقات الكترونياً ووفقاً لجدول زمني محدد مسبقاً وقانونياً. وتتضمن من الوحدات التالية:-
· وحدة البطاقة الالكترونية
· وحدة الرواتب
· وحدة الحفظ والسجلات
· وحدة الارشفة.