قد لا يخفى على الجميع ان هذه الشعبة تعد المفصل الاساسي في التعامل مع مستفيدي خدمات قسم الشؤون المالية من حيث المحصلة النهائية والاخيرة للمعاملات الصرف والتي من خلالها تقوم باهم الواجبات وهو تحرير الصكوك للمعاملات المنجزة والمدققة و متابعة الجداول التي ترسل شهريا الى وزارتي المالية والتعليم العالي والبحث العلمي ومتابعة السيولة النقدية مع مصرف الجامعة ومن وحداتها هي .
1- وحدة الصرف وقيود التسوية: تعتبر وحدة الحسابات ضمن التشكيلات التي يتم تمويلها اسوة بالكليات التابعة للجامعة وهي تقوم بتنفيذ الموازنة التي تتعلق بالمستلزمات الخدمية والسلعية وصيانة الموجودات بعد استحصال الموافقات الاصولية من خلال صرف الرواتب والمخصصات وتمشية كافة معاملات الصرف الخاصة بالكليات و مركز واقسام الجامعة بالإضافة الى اصدار كافة الصكوك واجراء التسويات القيدية ومستندات الصرف والتي تعد الخطوات الاولى للدورة المحاسبية المهمة.
أ- سجل المصروفات : يشمل هذا السجل جميع النفقات الجارية ومنها تعويضات الموظفين والمستلزمات الخدمية والمستلزمات السلعية والنفقات الرأس مالية والمصروفات الاخرى.
ب- سجل الايرادات: ويشمل هذا السجل على جميع الايرادات المتحققة لصالح الدولة ومنها ايراد ضريبة الدخل وايراد ايجار مباني سكنية وايراد مصروفات سنوات سابقة والتي تم استحصالها عن طريق قوائم صرف الرواتب او عن طريق اعادة المبالغ المصروفة سهوا وتعاد بطريقة نقدا عن طريق محاسب الكلية
2- وحدة امانة الصندوق : يقوم محاسب الصندوق بقبض المبالغ التي ترد الى الصندوق بموجب وصولات القبض المعتمدة لهذا الغرض وتسجيل المبالغ المقبوضة بحسب مفرداتها في سجل المقبوضات وعلى اساس الارقام المتسلسلة للدفتر وتسليم المبالغ المقبوضة المتجمعة الى المصرف الحكومي المعتمد لحساب الصندوق.